由于信息传递以及交通的极度不便利，决定返航之后，单是从荷兰、法国、英国、葡萄牙、普鲁士、威尼斯等诸多国家收拢人员便花去了数月时间，在一切准备就绪之后，船队从里斯本拔锚起航，踏上了回国的漫长航程。
在这接近五年的时间中，使团成员以及那些孩童、护卫、仆从等等，因为各种各样的原因，已经先后有数十人殁于异国他乡，这其中水土不服导致的急症突发是最主要原因。
现在的欧洲并没有诞生后世的那种西医医术，在没有抗生素的时代，急症突发就只能听天由命。
中医药对于慢性疾病的治疗是比较有效的，可面对急症也是束手无策。
随队的太医院太医胡方文虽然医术高超，但也只能眼睁睁看着发病之人在自己眼前慢慢离世，作为一名悬壶济世的医者，胡方文等人面对如此场景，内心的痛苦和自责旁人无从知晓。
罹难人员的尸骨就地火化后被装入陶罐带回大明，后续的抚恤事宜自有朝廷处置。
有了来时的经验，船队返航途中经过好望角时特意往西绕了个大圈子，避开了常年风暴肆虐的危险区域，虽说又多耗费了月余的时间，但安全性却有了立着数人，随着距离的拉近，这些人身上的穿着也是越来越清晰。
黑色的甲胄，锅盔型的斗笠上飘着红色的簪缨。
这是大明官军特有的装束，虽然甲胄颜色不是大红色，但式样却是别无二致。
“哪位是方侍郎、郑少卿？
本将乃大明北海舰队提督张文耀是也！
听闻方侍郎、郑少卿出访归来，特此前来迎接二位！”
原来，就在使团人员登岸后，正在马尼拉港附近转悠的张文耀得知消息赶了过来，正愁着整日没事可干的张文耀在听到使团官员的简略解说后，兴致上来地他立刻吩咐备船出港，亲自迎接远道回返的方以智和郑芝凤。
“老张，那些西班牙俘虏都看押在何处？
不知其中有无管辖港口的红夷？”
登上陆地的郑芝凤与张文耀在船上很快便熟络起来，两人都是喜欢说话胡扯之人，很快便在话题中找到了共同点：妇人，共同的兴趣和爱好让彼此之间的关系迅速拉近，还没等船队靠岸，两人就开始称兄道弟，就如同多年不见的故交一般。
“俘虏倒是抓获不少，因临来之前，圣上特意下旨，不得苛虐西班牙俘虏，故此某倒是未曾难为他们，现下都关在马尼拉城中，一日两顿饭管着。
老郑你问这作何？
莫非是惦记那些红夷妇人？
你此次不是带回来几名美妇吗？
话说，啥时候让老张我见识一番？
这西班牙妇人可没几个出挑的，不知老郑你的眼光如何，带回来的可是绝色？”
张文耀冲着郑芝凤挤眉弄眼的说道。
“成！
没问题！
稍后便让老张你开开眼！
不过，你得先帮我个忙！
赏赐前往欧洲时，西班牙税官曾羞辱与我，某一辈子也不曾被人如此对待，何况那厮还是个西人！
这数年来，某这心里一直憋着一口恶气！
某要去寻着那厮，好生整治他一番！
只望那厮还活着！
某非让他知道，恶了我皇明之人，是个何等结果！”