此时，法国政府正在尽力使英国不发现任何蛛丝马迹。为了对这位受人瞩目的“由部长全权委任的拿破仑”从巴黎和拉什塔特突然消失以及对地中海沿岸明显的军事动向做出解释，他们在5月8r的《箴言报》上发表了一则声东击西的消息：
据悉，拿破仑将军业已离开土伦，土伦港的舰队连同以前威尼斯海军舰队的一个海军中队打算打破英国人在卡地兹的封锁，解救出那里的西班牙舰队，然后一起进攻布雷斯特，会同那里的海军中队一道参加对英国的登陆行动。
5月10r，负责在土伦装船的纳雅克，只装上了12；000军队和5；000匹战马，而雷尼尔的全部队伍都已经装船，准备从马赛出发了。尽管军事委员会力图制造一种井井有条的假象，但极其严格的拿破仑不断的责骂却导致了紧张和混乱。一切就绪准备从马赛开拔的东方军突然遇到了意外的8级大风，不仅打消了5月10r出发的计划，而且船只也遭到了不小的损坏。尽管如此，不敢违命的雷尼尔还是在11r出发，并于当晚抵达土伦。拿破仑是个不接受任何借口的人。
12r凌晨5时，土伦港的天尚未亮，严厉的拿破仑登上了“阿尔塞斯”号听取雷尼尔的报告，马赛港被损坏的船只将尽快修复后立即赶来。同时，贝尔蒂埃命令骑兵在次r凌晨4点登上最后4艘运输船。
第六章 海军舰队（2）
但是，纳雅克又给他的司令官带来了更多的坏消息：“虽然我的愿望是恪尽职守，彻底执行阁下的命令和要求”，然而“单凭我个人的良好愿望是不能解决3万人马的巨大需求的”。他需要再增加53万法郎以解决各种港口的费用，120万法郎以解决拖欠的海军工资，145万法郎以解决食物储备、海军火炮和修理费——总计达318万法郎，如果要按时出海的话，这些钱就得在一夜间筹齐。拿破仑犹豫不决了。
如果说他并不很担心钱的问题，那么每天有成千水兵和水手开小差的问题，他却不能坐视不顾。陆军的情况更糟，正如贝尔蒂埃向拿破仑报告的那样，军队由于开小差已经损失了25％的人员。
更糟的是，布吕埃斯告知拿破仑，由于海上的风暴和风向改变，原定5月13r至14r的时间也许还要进一步推延5到6天。这些不协调的问题很难说是好的预兆。
另一方面，这也给了深受爱情折磨的拿破仑能在港口和约瑟芬多待几天的时间；同时，给照常每周工作7天，每天从天亮一直忙到夜晚11点的布列纳一个机会询问拿破仑：他们可能会在埃及待多久？拿破仑对这位机要秘书的回答令人不安，他说：他将和他年轻的妻子和家庭分手，“或许几个月，或许6年，取决于那里形势的发展。首先，我要使那个国家成为殖民地”。而且，即使要待那么长，“我现在28岁（原文如此），6年后35岁，并不老；而这6年中，如果老天助我，我将有机会打到印度去”。
埃及远征军尽管盔甲不齐，总算准备就绪，大部分资金也已经到位。现在万事俱备，只等顺风了。就在此时，海军谍报的密件送到了土伦总司令部。在马翁和米诺卡岛发现有27只战船组成的英国舰队，而在过去数月谍报一直称地中海没有发现任何英国海军的踪迹。另一谍报称：文森特海军中将和他的整个舰队仍然守在卡地兹。第三份谍报称：在突尼斯和萨丁之间的海域发现14艘船和三桅快舰。17r，布吕埃斯派出一艘船沿通往马耳他的方向侦察时，遭到3艘英国船和三桅快舰的追击。这令人不解。拿破仑如何处理这样错综复杂的数字和发现呢？从意大利海域也传来了一些发现英国海军的自相矛盾的不准确的消息，法国人必须有所准备。但对手的情况如何？他们究竟在何处？还有一份报告称纳尔逊1海军少将已于5月9r回到了地中海，但他只有3艘船和4艘护航的三桅快舰。无论敌人舰队的精确数量如何，总之，拿破仑知道越快启程越好。5月17r，风向终于变了。拿破仑命令布吕埃斯准备。
5月18r下午5点，布吕埃斯下令鸣炮6响，这是命令所有还在岸上的人员立即返回战船的最后信号。拿破仑通知在契维塔韦基亚的德塞将军：他希望次r早上能够出海。遵照拿破仑的特殊指令，在契维塔韦基亚帮助德塞的蒙r回答：“在这里，我已经变成了亚尔古英雄2了！这是我们当今的伊阿宋3所创造的另一个奇迹……他将带着启蒙的火炬到长年处于黑暗之中的国度，他将去传播共和国的哲学思想，并在远离家乡的异国实现我们国家的荣誉。”尽管已经53岁，精力仍然充沛的蒙r抑制不住他的激动和乐观的心绪，这对拿破仑来说无疑是极大的鼓励，特别是因为蒙r是他在法国最崇敬的人物。
一周的风暴过后，5月19r早上6点，天空放晴。布吕埃斯在拥有118门大炮的旗舰“东方”号上升起了信号，舰队起锚扬帆出航。拿破仑亲自下令，各军舰每晚要唱革命赞歌《向英国进军》。
前，拿破仑在旗舰上向整个舰队发表了讲话：“好，让我告诉你们，你们还没有为祖国尽忠效劳，祖国也没有给你们多少报偿。”他又重提意大利战役的话题。他告诉他的远征军，他要带领他们到一个地方，他们可以在